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Depende do seu objetivo.
Alguns sгo mais rбpidos, porйm menos prбticos.
Outros sгo mais prбticos, e menos rбpidos.
E tem aqueles que sгo medianos nos dois requisitos.
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Eu recomendo, fazer uma mesclagem, entre MySQL e um GA de sua preferencia (dof2, y_ini, dini, nat...)
Porque cada caso й um caso, й muito bom equilibrar!
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Recomendo usar quase tudo em um banco de dados estruturado (SQLite/MySQL) porque vocк tem maior controle em tempo de execuзгo (se seu projeto for bem feito). Algumas ocasiхes sгo mais eficientes com dados salvos em arquivos dentro da mбquina, mas apenas dados nгo essenciais.