Simplemente es como windows pero cambian algunos archivos y la forma de encenderlo.
http://team.sa-mp.com/files/samp03csvr.tar.gz
Te bajas eso que es el server para la version linux , hay pones tu gamemode y lo configuras todo , si usas plugins tienen que ser .so
Luego te conectas por ftp a tu vps , puede ser con filezilla perfectamente , y creas una carpeta llamda samp
Luego pones hay todos los archivos de tu server y les das permisos 755 para que se ejecuten
Luego conectandote por consola a tu vps , con putty por ejemplo haces esto
cd .. (enter)
cd samp (enter)
y te saldra -> root@tuvps/samp:
eso es que ya estas en la carpeta de tu server , luego pones
nohup ./samp03svr &
y el server Se enciende y se mantendra encendido aunque cierres la consola
Si no me entiendes nada de nada investiga por aqui ->>
https://sampwiki.blast.hk/wiki/Linux_Server
Saludos
EDITO: Pusistes el post de arriba mientras escribia este , te recomendo que la parte de wget la hagas tu como te dije ya que hay se descarga la antigua , pero como tu veas. Si tienes dudas dinos